Como uma alternativa a falta de oportunidades de estágio na cidade, um grupo de alunos se reuniu com o apoio de diversos professores da unidade e deram início a abertura da empresa júnior. Nesse início, não existiu nenhum apoio financeiro e de estrutura para que as atividades da Empreender começassem a acontecer, nossos fundadores precisaram utilizar dinheiro próprio para cumprir com todas questões legais e abrir oficialmente nossa empresa. Devido a falta de uma sala as atividades e reuniões eram realizadas no salão de festa de um prédio da cidade. Vale ressaltar que nem sempre nosso nome foi Empreender Jr., durante esse processo de abertura foi cogitado Omega Jr. e até mesmo FAAGRO Jr., até o momento que chegaram ao Empreender Jr..
Foram diversos desafios nesse primeiro momento, dificuldade de se inserir no Movimento Empresa Júnior (MEJ); falta de confiança dos empresários; pouco apoio da universidade pelo fato de o campus ser novo; e até mesmo poucos membros envolvidos com a empresa. Mas, tudo isso foi modificado aos poucos com muito trabalho e dedicação, gestão após gestão, ano após ano.
Ao longo desses 15 anos de história realizamos mais de 80 projetos comerciais e contando com o trabalho de aproximadamente 200 membros que deixaram seu legado em nossa empresa.